Wenn Ihr unter Windows Server 2008, 2008 R2, 2012 oder 2012 R2 einen virtuellen Ordner oder eine Anwendung im Internet Information Service (IIS, also dem Webserver) umbenennen wollt, so geht das nicht über die GUI, den IIS Manager.
Vielmehr müsst Ihr das auf Befehlszeilenebene machen:
CD C:\Windows\SysWow64\inetsrc
appcmd set APP "Meine Website/AlterNameDesVirtuellenOrdners" -path:/NeuerName
Um herauszubekommen, wie die Website aus appcmd-Sicht heißt, könnt Ihr einen dieser Befehle verwenden:
appcmd list APP
appcmd list VDIR